Solutions d'analyse de données - Photométrie par fibre optique

danse™ est une plateforme d'analyse de données Conçu pour les neuroscientifiques utilisant la photométrie des fibres et les données comportementales. Grâce à des workflows intuitifs, créez des pipelines qui automatiser plusieurs opérations (Supprimer les artefacts, z-ΔF/F0, Rechercher les pics, PeriEvent, etc.), sans aucun codage requis. Le logiciel aussi importe et aligne les données de comportement à partir de sources non doriques (vidéos, csv, DIO, etc.).

Au-delà des analyses d'enregistrements uniques, dansez™ facilement regroupe des données multi-animaux selon votre conception expérimentale et réexécutez les analyses sans effort avec de nouveaux paramètres —gagner du temps et accélérer publications.

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Danse™ est compatible avec les données de photométrie et de comportement des fibres doriques et non doriques. Plusieurs opérations d'importation et de conversion seront décrites ci-dessous.

Ce guide de 10 minutes présente un aperçu du flux de travail d'analyse danse™ :

Plus d'une douzaine d'opérations de photométrie par fibre sont disponibles et peuvent être sélectionnées pour un traitement par lots. Voici quelques exemples et leurs tutoriels vidéo : Consultez la section FAQ ci-dessous pour connaître les erreurs courantes et les solutions. Pour les mises à jour des fonctionnalités, consultez notre newsletter mensuelle sur LinkedIn.

Cette opération génère des horodatages de comportement ou de stimuli survenus pendant l'enregistrement de la photométrie par fibre. Ces horodatages peuvent être uniquement les paires de début, de décalage ou de début-décalage.

Ces horodatages sont appelés Événements en danse et sont importants pour le fonctionnement combinant les données neuronales et comportementales.

Les événements de comportement peuvent être créés à partir de .csv importé données, saisi manuellement points temporels, à partir d'enregistrements numérique (TTL) ou analogique signaux, ou à partir de mesures créées dans danse™ (vitesse, présence du score de mouvement dans la zone, distance du point, etc.).

Les événements de comportement sont des entrées obligatoires pour les tracés PeriEvent et Signal Statistics.

Utilisez le Créer des périodes de temps fonctionnalité permettant d'examiner comment l'activité neuronale évolue au fil du temps et/ou de noter un sous-ensemble d'événements comportementaux se produisant à certains moments.

Périodes de temps manuelles: Définir des fenêtres de longueurs variables où l'animal a rencontré ou expérimenté différents contextes (ligne de base vs manipulation, nouvelle cage, injection de drogue, etc.).

Périodes de temps automatique: Divisez l'enregistrement entier en pair fenêtres temporelles (secondes, minutes, heures).

Les histogrammes de péri-événement (également appelés histogrammes de temps péri-stimulus ou PSTH) visualisent changements dans l'activité neuronale en réponse à l'apparition (ou décalage) d'un stimulus ou d'un comportement d'intérêt (c'est-à-dire event). Ce tracé est calculé en alignant et en faisant la moyenne du ΔF/F0 centré autour de ce point. Il en résulte un histogramme qui montre réponse neuronale moyenne au fil du temps.

Les statistiques associées à la trace PeriEvents sont également calculées, notamment l'aire sous la courbe (AUC), le maximum, le minimum, etc.

Tracez un graphique thermique des événements péri-événementiels. Pour les événements péri-événementiels d'un animal, chaque ligne correspond à un événement (essai/combat), tandis que pour les événements péri-événementiels d'analyse de groupe, chaque ligne correspond à la trace moyenne d'un animal.

Combiner données d'activité neuronale et de suivi des animaux dans une carte thermique du signal spatialLes axes x et y de la carte thermique correspondent aux dimensions de la cage et la couleur est associée au ΔF/F0 moyen lorsque l'animal se trouvait à cet endroit. Signal spatial L'opération est idéale pour des analyses telles que la préférence condition-lieu, le labyrinthe en plus, le nouvel objet, les interactions animales et les cellules de lieu hippocampiques, entre autres.

La Statistique du signal l'opération examine les changements dans l'activité neuronale sur toute la durée de la durée totale d'un événement/d'une période (c'est à dire (pas seulement le début/la fin de l'événement). Cette opération est idéale pour les comportements de durée variable (gel, entrée dans une zone, interactions avec les animaux, etc.).

Calculez les statistiques suivantes :

• z-ΔF/F0 : ASC, moyenne, médiane, max, min
• Spikes : amplitude, fréquence de déclenchement, nombre de pics

Que se passe-t-il si chaque fichier contient plusieurs animaux enregistrés ensemble ?

Utilisez le Opération de division pour diviser le fichier en plusieurs fichiers (un par animal).

Comment convertir des données de photométrie à fibre non dorique ?

De nombreuses données de photomérie des fibres sont compatible avec danse™, y compris Tucker Davis Technology (TDT), Neurophotometrics, RWD et tout système personnalisé (.csv/.xlsl). Plusieurs opérations de conversion sont disponibles :