La photométrie à fibre à double bande d'excitation combinée à l'optogénétique utilise un mini cube de fluorescence avec 5 ports : un pour l'excitation GCaMP de 460 à 490 nm, un pour l'excitation isosbestique de 405, 415, 425 ou 440 nm, un pour la fenêtre d'excitation isosbestique et fonctionnelle de 500 à 540 nm. détection de fluorescence, une pour la lumière d'inactivation de l'opsine de 580 à 680 nm et une pour l'échantillon soumis au test. Le cube est doté de miroirs dichroïques pour combiner les excitations isosbestiques et fluorescentes, isoler l'émission de fluorescence et laisser passer la lumière de stimulation de l'opsine. Dans le même temps, des filtres passe-bande étroits limitent le spectre de fluorescence d’excitation.

La lettre "E" représente l'excitation de fluorescence, "IE" l'excitation isosbestique, "F" la fluorescence, "O" la lumière de stimulation opsine et "S" le port d'échantillon sur le schéma du cube.

La séparation des signaux de fluorescence fonctionnelle et isobestique de GCaMP est possible avec des sources lumineuses modulées. L'anneau de réglage de l'intensité de la source lumineuse LED 460-490 nm réduit sa puissance en dessous de la plage du pilote LED si nécessaire pour les expériences de photométrie fibre à faible puissance.

Par rapport aux Mini Cubes Fluorescence avec uniquement des connecteurs FC sur tous les ports, ceux avec photodétecteurs intégrés offrent un rapport signal/bruit 100 % meilleur (augmentation du signal de 30 % et réduction du bruit de 40 %). De plus, dans la dernière version des Mini Cubes, des LED et des pilotes de LED sont également intégrés pour réduire le nombre de connexions et l'empreinte globale du système. Dans sa version, il est également possible de remplacer le filtre d'excitation (pour ajuster l'excitation isobestique de 405 nm à 410 nm par exemple) et de diminuer la puissance d'excitation en ajoutant des filtres atténuateurs (pour la photométrie à faible puissance).