Studio de neurosciences doriques V6

Studio de neurosciences doriques V6

Téléchargements de Doric Neuroscience Studio


Version Date de sortie Télécharger
6.4.1.0
2024-04-22
download
6.3.2.0
2023-12-15
download
6.2.4.0 2023-06-15 download
6.1.5.0 2023-03-27 download
5.x
2021-10-15

 

  • Doric Neuroscience Studio est une suite logicielle intuitive avec de multiples modalités. Il contrôle le matériel Doric et enregistre et analyse les données expérimentales de l'optogénétique, de la photométrie des fibres, de la microscopie à fluorescence miniature, de l'électrophysiologie et des caméras comportementales.

     

    Le logiciel Doric Neuroscience Studio, avec ses différents modules, contrôles le suivant Dispositifs doriques:

    • Sources lumineuses (DEL, diode laser, ★LISER™)
    • Console de photométrie à fibre
    • Système d'imagerie groupée
    • Microscope à fluorescence miniature
    • Headstage d'enregistrement électrophysiologique
    • Générateur d'impulsions TTL d'optogénétique
    • Caméra comportementale

     

    En plus de contrôler ces appareils, le logiciel contient les éléments suivants modules d'analyse de données pour le traitement des données acquises :

    • Module d'analyse d'images microscopiques (correction de mouvement, ΔF/F, ...)
    • Module d'analyse du signal (photométrie fibre ΔF/F, filtres, arithmétique, recherche de pointes, ...)
    • Module d'analyse du comportement (suivi en champ libre, score de mouvement et vitesse)
    • plus de détails à venir bientôt

     

    UNE INFORMATION IMPORTANT : Avant de passer de la version 5 à la version 6 du logiciel Doric Neuroscience Studio, les utilisateurs des produits Doric Lenses doivent lire ce qui suit informations:

    • DNS v6 nécessite une mise à jour du firmware du matériel

    Ceci est fait par l'utilisateur avec le logiciel Doric Maintenance Tool inclus dans le fichier d'installation. Bien qu'une documentation détaillée soit bientôt ajoutée, les boutons "Vérifier les mises à jour du serveur" et "Mettre à jour depuis le serveur" devraient fonctionner correctement.

     

    • DNS v6 enregistre les données dans un fichier HDF5 avec l'extension ".doric"
    •  Les fichiers enregistrés avec DNS v6 peuvent être analysés avec ses modules d'analyse de données non disponibles dans les anciennes versions. Les fichiers HDF5 peuvent être lus avec Matlab, Octave et Python. Des exemples de code sont fournis pour faciliter l'analyse des données avec ces applications externes :
    • MATLAB download
    • OCTAVE  download
    • PYTHON  download
  • Système d'exploitation Microsoft Windows 10, 11 ; 64 bits
    Mémoire 8 Go de RAM minimum
    16 Go de RAM recommandés
    La vitesse du processeur 3 GHz et 8 cœurs ou plus
    Disque dur 2 Go d'espace libre sur le disque dur
    * SSD recommandé

  • Logiciel Doric Neuroscience Studio
    • Brochure Web
    Procédure de mise à niveau et de rétrogradation du micrologiciel pour Doric Neuroscience Studio v5 et v6
    • Note d'application
    Logiciel Doric Neuroscience Studio
    • Manuel utilisateur
    Présentation des déclencheurs
    • Vidéo
    Comment configurer la configuration de verrouillage avec FMC G1 ou G2 et FPC
    • Vidéo
    Comment configurer la configuration de verrouillage avec FMC G3 et FPC
    • Vidéo
    Comment configurer la configuration Lock-In avec FMC G3 et NC500
    • Vidéo
    • Version 6.4.1.0


      [VERSIONS DE PLUGINS INCLUSES]
      • Outil de maintenance dorique 1.2.4.0
      • Analyseur de comportement 1.1.4.0
      • Éditeur de fichiers doriques 1.3.18.0
      • Analyseur d'images 1.1.5.0
      • Analyseur de signaux 1.1.5.0

      [GÉNÉRAL]
      • Améliorations du nettoyage et de l'abstraction du code interne
      • Utilisez la vérification TimeON/TimeOFF lors du calcul de la fréquence d'impulsion pour garantir que la résolution de synchronisation de l'appareil est respectée.
      • Correction de l'enregistrement TimeSeries avec l'utilisation de la caméra
      [Caméra comportementale]
      • IMPORTANT: Modification de la façon dont les vidéos de la webcam sont enregistrées pour interpoler la perte d'images et pour s'assurer que le nombre d'images correspond à la durée de la vidéo multipliée par le FPS.
      • Le format vidéo a été modifié en .mp4
      • Correction du mode Time Series avec les caméras, en enregistrant une vidéo par série.

      [BBC300]
      • IMPORTANT: Amélioration de la communication USB2 pour améliorer la fiabilité des enregistrements longs
      • Ajoutez la possibilité d'utiliser la sortie analogique comme canaux autonomes

      [CPE/FPC]
      • Correctif de mise à jour du filtre LPF du FPC/EPC lors de l'utilisation de plusieurs Ain
      • Ajout de la possibilité de supprimer la détection de déphasage
      • Correction de l'unité de sauvegarde de la configuration, de la plage et du zoom

      [NC500]
      • L'entrelacement peut gérer jusqu'à 4 signaux (1 entrée analogique peut être désentrelacée avec 4 DIO)
      • Corriger l'utilisation du wattmètre avec le NC500
      • Correction de l'unité de sauvegarde de la configuration, de la plage et du zoom
      • Correction du déclenchement des paramètres globaux (GATED & TRIGGERED)

      [Sources lumineuses]
      • Correction du décalage de l'aperçu lors du redessin avec un délai de démarrage
      • Correction de la limite CW lors de l'utilisation en mode complexe

      [FMD3]
      • • Correction d'un problème lors du recadrage après le regroupement
      • • Modifier le nom par défaut du ROI
      • Chargement de la configuration et des ROI et enregistrement des corrections de bugs mineurs


      Version 6.3.2.0

      NOTES IMPORTANTES :

      • Dans cette version, la structure des fichiers a été modifiée. Les configurations de certains appareils peuvent ne pas fonctionner correctement. Dans de tels cas, vous devrez créer une nouvelle configuration.
      • La structure des données de verrouillage FPC a été modifiée. Pour plus d'informations, se référer à la note d'application dédiée (Lien).
      • La communication USB3.x des systèmes NC500 et FMD3 a été mise à jour. Une mise à jour du pilote/micrologiciel de ces appareils dans Doric Maintenance Tool est requise avant d'utiliser cette version du logiciel.
      • L'amélioration de la gestion TEC pour les sources lumineuses CeYAG nécessitera une mise à jour du micrologiciel avec Doric Maintenance Tool.

      [VERSIONS DE PLUGINS INCLUSES]
      • Outil de maintenance dorique 1.2.2.0
      • Analyseur de comportement 1.1.3.0
      • Éditeur de fichiers doriques 1.3.18.0
      • Analyseur d'images 1.1.5.0
      • Analyseur de signaux 1.1.5.0

      [GÉNÉRAL]
      • Enregistrer/charger la configuration pour plusieurs appareils (préliminaire).
      • Ajout de la possibilité de générer des événements à partir d'un signal DIO (en plus des événements clavier existants)
      • Amélioration de la réactivité de connexion des appareils
      • Problème de fermeture des logiciels et des périphériques USB.
      • Améliorations des vues générales et des aperçus des signaux dans l'interface utilisateur
      • Améliorations de la gestion du retour sur investissement.
      • Chronométrage des séries chronologiques.
      • Chargement des événements dans l'analyseur de signal/image.

      [BFPD]
      • Problème de timing dans certaines configurations prédéfinies.
      • Les changements de puissance de la source lumineuse ne sont pas toujours mis à jour lors de l'édition.

      [BBC300 (anciennement BFPD_Gen2)]
      • L'appareil s'appelle désormais BBC300 par défaut
      • Vue bloquée pendant les séries chronologiques
      • Problème de sauvegarde/chargement des événements
      • Problème de redimensionnement du tracé de données
      • Améliorations des fonctionnalités de configuration et de paramétrage

      [CPE/FPC]
      • Nouveau verrouillage démodulé et structure de données entrelacées
      • Taille des fragments re-déterminée réduite d'un facteur 10 pour réduire la taille des enregistrements courts.
      • Problèmes de configuration/calcul lorsque les mêmes canaux Aout sont partagés avec plusieurs canaux Ain (configurations de plusieurs minicubes)
      • Certains paramètres de configuration sont réinitialisés suite à une édition en mode Lockin
      • Problème de configuration du filtrage Ephys HS-T16

      [NC500]
      • Nouveau verrouillage démodulé et structure de données entrelacées
      • Améliorations de l'interface et de la stabilité
      • Améliorations des paramètres de verrouillage (fréquence LockIn LPF désormais déverrouillée)
      • Microscope et Ephys. améliorations de la configuration et de la gestion des headstages
      • Intégration du wattmètre
      • Problème d'enregistrement des canaux AOut suite au chargement/édition d'une configuration

      [Caméra comportementale]
      • Chargement de la configuration, corrections de bugs mineurs

      [Sources lumineuses]
      • Simplification de l'interface en mode overdrive et basse consommation.
      • LISER : Problème de valeurs de température

      [OTPG]
      • Chargement de la configuration et enregistrement des corrections de bugs mineurs

      [Éditeur de fichiers doriques]
      • Gérer NaN
      • Correction d'un bug de réinitialisation de l'heure dans certaines données importées
      • Améliorer l'ouverture et la fermeture des fichiers doriques,
      • Utilisez la nouvelle fonction de reconditionnement, reconditionne le fichier s'il détecte qu'il a été corrompu
      • Supprimer la décimation du signal sur les tableaux 2D
      • Définition de nouveaux espaces de noms et autres améliorations de la structure des fichiers

      [Analyseur d'images]
      • Correction du chargement des données converties et importées

      [Analyseur de signaux]
      • Photométrie améliorée dF/F (option ajoutée pour le début/le décalage des rejets)
      • Correction du chargement des événements sur les signaux DIO.

      [Outil de maintenance dorique]
      • Prise en charge du pilote Cypress (périphériques USB3.x)
      • Utilisez des identifiants (énumération) au lieu de noms (QString) pour identifier tous les appareils
      • Corrections générales de bogues


      Version 6.2.4.0

      Nouvelles fonctionnalités :

      • Ajoutez la commande Démarrer tout/Arrêter tout lors de l'utilisation de plusieurs appareils Doric
      • Calcul du retour sur investissement du BFPD et de l'analyseur d'images et amélioration de la sauvegarde des coordonnées.
      • La source de lumière réduit la hauteur de vue du canal pour voir 4 canaux dans une hauteur d'affichage de 1080 pixels.
      • Acquisition de l'état du moteur AERJ (nécessite une mise à jour du firmware, et un port USB 2 Ampères)
      • Menu Aide/Priorité pour augmenter la priorité MS Windows du processus Doric Neuroscience Studio et réduire la perte de données.
      • Modifier la configuration par défaut du canal de verrouillage d'entrée analogique FPC

      Corrections de bugs:

      • Différence de longueur d'ensemble de données FPC pour différents canaux d'entrée analogique.
      • Problème d'interface des paramètres de filtre du système EPC Tethered.
      • BFPD enregistre un fichier avec une taille de bloc prédéterminée pour faciliter une gestion étendue des fichiers.
      • Problème d'index OTPG, BFPD Time Series avec plus de 256 séries (nécessite une mise à jour du firmware).
      • Problème d'édition de la source lumineuse avec les options déclenchées et la configuration du chargement.
      • Fuite de mémoire d'aperçu de l'impulsion carrée de la source lumineuse.
      • Adressage source LISER.
      • Bloquez l'enregistrement avec un chemin de fichier incorrect ou avec un fichier contenant des caractères spéciaux.
      • Améliorations générales de la vue.

      Version 6.1.5.0

      Nouvelles fonctionnalités :

      • Nouveau module Doric File Editor, remplace le module HDF5 Viewer avec plus de possibilité d'importer, de fusionner et d'exporter des données avec des fichiers CSV et .doric HDF5.
      • Le NC500 est désormais entièrement pris en charge.
      • Les caméras Doric Behavior ont un nouveau bouton de calibrage automatique, il remplace le gain automatique, l'exposition automatique et la balance des blancs.
      • BFPD et OTPG ont déplacé la fonction Time Series dans Global Settings
      Corrections de bugs:
      • Problème de nom des canaux de verrouillage FPC.
      • Problème de noms enregistrés EPC.
      • FPC Améliorez le comportement de zoom des graphiques X et Y sans le clavier.
      • Problème de mode complexe des sources lumineuses lié au chargement de certaines configurations.
      • Nouveau nom par défaut pour les fichiers de configuration.
      • Améliorations générales de la vue.


      Version 6.1.4.0

      Nouvelles fonctionnalités :

      • Enregistrement manuel des événements d'appui sur les touches
      • Prise en charge de l'enregistrement vidéo par webcam générique en tant que canal avec console, microscope ou OTPG
      • Nouvelle fonction d'étalonnage de Doric Behavior Camera pour enregistrer un facteur d'échelle avec la vidéo
      • FPC nouveau mode de sortie analogique - Escaliers
      • Nouveau mode de sortie analogique FPC - Séquence de fichiers personnalisée
      • Sources lumineuses (LED, laser, LISER) nouveau mode - Séquence de fichier personnalisée

      Corrections de bugs:
      • Menu déroulant de la liste des détecteurs FPC
      • FPC - paramètres de verrouillage, réduit la valeur minimale de puissance à 5%
      • FPC - paramètres de verrouillage, ajout de la possibilité de définir un nouveau nom d'utilisateur dans l'interface de configuration du canal (n'était possible qu'à partir de l'interface d'édition des graphiques)
      • BFPD – Amélioration du calcul des retours sur investissement pour prendre en charge davantage de retours sur investissement
      • BFPD - Améliorer la réponse du curseur d'exposition
      • BFPD - Améliorations de la configuration de charge
      • Améliorations générales liées à la configuration de l'affichage, du déclenchement et du chargement